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以前有个笑话,说有一个人吃了七个烧饼,吃饱了,就很后悔:“早知道第七个烧饼能吃饱,还吃前六个干什么?” 最常见的作用大概就好像牙床。你的牙可以用,牙床有什么用呢……无论你的答案是什么,都可以套在这上面。 当然,这有点像抬杠的说法。 很多人把蛋白质理解为机器。这种类比在功能上可能有些道理。但具体到结构方面,根本没有任何可比性。 任何机器都需要让使用者明白机器运作的原理,需要直观。知道什么东西放在哪里,…
做小分子筛选咯 资金充足可以考虑直接购买小分子库然后做高通量筛选 也可以考虑做计算机端的模拟然后再小规模的进行实验验证(有晶体结构的前提下) 我手头正好有一个相关的项目,给题主大概描述一下到现在为止我做了些什么 首先是寻找该蛋白的晶体结构,最好是野生型的(没有晶体结构会比较麻烦,得涉及到同源建模之类的怪东西) 然后对该晶体结构进行蛋白表面扫描,寻找潜在的小分子结合位点。这一步可以扩展为先进行分子模拟…
如今,植物蛋白饮料被更多人推崇,成为了世界性的饮料。那么,到底什么是植物蛋白,它与 动物蛋白 又有怎样的区别呢?各自代表的饮料又有哪些?我们平时又到底该各自摄入多少才能更营养呢? 一、植物蛋白与动物蛋白首先我们来说说什么是植物蛋白和动物蛋白。 1 植物蛋白 1 )什么是植物蛋白植物蛋白是蛋白质的种类之一。虽然其来源于植物,但与动物蛋白相仿,营养全面,而且容易被人体吸收。 [图片] 知道了什么是植物蛋白,我们再来看看…
这个问题提的好,科学家们正在研究这个问题。目前的学界在这个问题上的回答,尚处于拓荒阶段,题主这个时候如果进来插一嘴,没准能发个CNS。朊病毒吸引了很多科学家的兴趣,甚至现在还有一本叫做 Prion(《朊粒》)的学术期刊。“为什么会有朊病毒的存在”,这个问题实际上可以分为两个部分,一是客观性的,即朊病毒存在的意义是什么,它发挥了什么积极作用吗?二是历史性的,即朊病毒在进化史上是怎么产生的,它缘起于哪里? Pr…
高效提分!《蛋白质与酶工程》专业课资料丨重点总结+知识汇总+练习题库答案!
蛋白质与酶工程的内容繁多而复杂,部分同学可能因为上课没有好好认真听而错过了重点,到复习时还在寻找重点知识。
临近考试,复习的压力瞬间上来,这也成为同学们十分苦恼的一个点。这个时候,我们就可以考虑利用…
NeuIPS | 蛋白设计新方法?基于图的蛋白生成模型
[图片] 今天给大家介绍的是麻省理工大学计算机科学和人工智能实验室在NeuIPS 2019会议上发表的一篇文章。在文中,作者提出了一种基于图结构的蛋白质序列生成模型,通过聚焦三维空间上相邻的蛋白质区域,在基于神经网络的生成模型的蛋白质序列复杂度有了显著改善,并且比最先进的Rosetta程序生成序列更准确和高效。 1.背景计算蛋白质设计的一个中心目标是自动创造具有明确结构和功能特性的蛋白质分子。本文中提供了一个自上而下的蛋白质…
我分享下我的看法。 1.先解释这个双向琼脂扩散法的图: [图片] 这个图的区别是抗体的抗原决定簇完全相同 or 完全不同 or 部分相同,详见下图(取自周德庆《微生物学教程》第4版 P311) [图片] 对于(b),因为抗原决定簇完全不同,左边的沉淀线是由Ab(抗体)中的Ab1(抗体1)与Ag1(抗原1)结合形成的,因为沉淀线只由这两个区域扩散出来的物质组成,假设两者扩散速率相同,那么随着扩散,沉淀线会出现在两个样品连线的中垂线上。这就是为什么…
了解一下 π-HuB 计划
导读 2022年12月30日,科技部副部长、广东省副省长以及15位院士等专家汇聚一堂,召开人体蛋白质组导航计划(Proteomic NavIgator of the Human Body,简称π-HuB计划)启动前期工作座谈会。 据了解,这是由我国科学家主导、发起,并得到国内外科学界广泛响应和支持的国际大科学计划,中科院院士贺福初为该计划首席科学家。 目前,π-HuB计划组建了一支生命组学、临床医学、数据科学、人工智能等领域的20余位两院院士领衔的顶尖人…
【快讯】Rosetta MPNN新一代的蛋白设计引擎
参考文献:Robust deep learning based protein sequence design using ProteinMPNN 解读作者:吴炜坤-力文所 一、背景 今年5月份的RosettaCon EU 2022无疑也是标志RosettaCommons社区向Rosetta DL转型的拐点,其中就专门开设了2小时的专题讨论Rosetta全面免费开源和社区发展走向。值得一提的是,在众多报告中都出现了一个高频词汇,那就是Rosetta MPNN “Mover”,新一代Rosetta的蛋白设计内核。基于图的蛋白序列设计技术日渐成…