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2009年，获北京大学医学部优秀人才奖；

饶毅、张大庆、黎润红著，呦呦有蒿：屠呦呦与青蒿素，获中国出版协会2015年度中国30本好书奖；获2016年第四届中国科普协会优秀作品金奖；

《医学人文学导论》获2014年北京市第十三届哲学社会科学优秀成果奖；

《科学编年史》获2014年上海市自然科学成果二等奖，主要完成人。