1928年，受濑越宪作派遣， 桥本宇太郎 四段来到中国，安排与吴清源的考试棋与赴日留学事宜。这期间桥本宇太郎让先与吴清源对弈的两局考试棋皆败。10月23日，吴清源赴日留学，当时的日本名人 秀哉 亲自率领众棋士到火车站迎接。吴清源到了日本，时任日本棋院总裁大仓喜七郎答应每月资助吴清源200日元，两年为期。两年以后，吴清源能否在日本站住脚，即能不能得到日本棋院承认他具有作一个棋士的资格，就要看他的棋力能否长足进步。日本棋院组织一个审查会来给吴清源评定段位等级。审查会共七人： 本因坊秀哉 九段、岩佐銈七段、濑越宪作七段、 铃木为次郎 七段、加藤信六段、 岩本薰 六段、 小野田千代太郎 六段。审查会选出蓧原正美四段、村岛义胜四段、 前田陈尔 四段、桥本宇太郎四段、小野田千代太郎六段、 木谷实 四段和本因坊秀哉九段七人分别与吴清源对局。吴清源先胜蓧原正美、本因坊秀哉和村岛义胜三人。审查会根据这个成绩，便评定吴清源为三段。评为三段之后，吴清源继续同其余四人对局。结果只输木谷实一局，其余全胜。吴清源认为，木谷实是他最早遇到的劲敌。

1929年，吴清源在《 时事新报 》主办的 擂台赛 中与木谷实相遇，开创了“ 模仿棋 ”的先例。

1930年，吴清源晋升四段，并在这一年成为日本棋院的正式棋士，开始参加日本棋院的一年中春秋两度的 大手合 （相当于段位赛）。

1931年，吴清源参加东京时事新闻社发起的棋赛。比赛采取 单淘汰制 。吴清源连战皆捷，十八名棋手都败在他手下。他连胜的声威引起日本棋界的注目，时事新闻社连续刊登他的对局约半年多。

1932年春季比赛中，他又获全胜，取得第一名；同年秋季比赛中，他仅负于小岛春一一局，名次与木谷实并列第一。 ^[2-3]