1、杨焕明 著. “天”生与“人”生 - 生殖与克隆. 科学出版社. 第1版. 2008年3月
2、杨焕明.生命科学发展的历史缩影. 1-12 页. 徐熊 著.让生命之树常青—人类DNA揭秘.新华出版社. 第1版. 2003年1月
3、杨焕明 主编. 破解遗传密码. 北京少年儿童出版社/北京教育出版社.第1版.2002年9月
4、杨焕明, 深蓝, 张秀清, 汪建, 刘斯奇, 于军 著. 生命大解密: 人类基因组计划. 中国青年出版社. 第1版. 2000年4月
5、杨焕明. “人类基因组” 226-242页 (第12章). 李璞 主编. 医学遗传学. 中国协和医科大学出版社.第1版. 1999年5月
6、杨焕明. 普通高中课程标准实验教科书(必修):生物(第二册):“我赞叹生命的美丽 — 与杨焕明教授一席谈”. 人民教育出版社. 第1版. 2004年5月
7、杨焕明. 主译 基因的分子生物学 第7版. 科学出版社. 2015年3月
8、杨焕明. 生物科学研究方法丛书 基因组学方法. 科学出版社. 2015年12月
9、杨焕明. 基因组学 2016版. 科学出版社. 2016年10月
10、杨焕明. 基因脸谱 科学出版社. 2021年
11、杨焕明. 运动生理学彩色图谱. 科学出版社 2023年
12、杨焕明. 生命是什么 湖南科技出版社 2023年