从成立到 抗日战争 前夕的近两年时间内，出版4种 期刊 (如 《 新世纪 》、《语文》等)；在出版的20多种社会科学书籍中，如吴清友翻译的《 帝国主义论 》、 薛暮桥 的《农村经济底基本知识》、 吴大琨 的《大众政治经济学》等,都对读者起到积极作用,也扩大了新知书店在出版界的声望。抗日战争初期， 总店 先后迁至武汉、桂林(以后迁至重庆)；同时在重庆、金华、丽水、 常德 、襄阳、柳州等城市设立多处 分店 ，在香港设立办事处(后改分店)。总店在武汉时，受中共 长江局 的委托，以“ 中国书店 ”名义出版马克思主义经典著作 (如《“左”派幼稚病》、《论反对派》、《 国家与革命 》等)和党的文献(如《中国共产党党章》、《毛泽东救国言论集 》等 ) 。它陆续出版的社会科学论著(如 胡绳 《 辩证法唯物论入门 》、 薛暮桥 《经济学》、 翦伯赞 《 历史哲学教程 》等)及文艺作品(如 夏衍 《小市民》、《心防》等 )和很多通俗读物，在读者中有广泛影响。因此,国民党政府对新知书店的迫害日益加剧,书刊屡遭查禁，分店陆续被查封或被迫停业，人员屡遭逮捕。到1941年 皖南事变 ，国内分店只剩下重庆一处。但他们除坚持继续用“新知”名义出书外，还设立了远方书店、实学书局，出版了不少书籍。1945年抗日战争胜利后, 总店 迁回上海。1947年底又被迫迁到香港。1948年10月与 生活书店 、 读书出版社 合并成立三联书店。新知书店从成立到合并，先后出版发行期刊10种，出版各类图书200多种。