自16世纪晚期，哈扎拉人在波斯 萨法维帝国 的史书中和印度 莫卧儿帝国 开国君主 巴卑尔 的回忆录中开始出现，被描述为居住在 喀布尔 以西到 古尔省 ，南到 加兹尼省 这个地区。

自从18世纪中叶现代 阿富汗 国家形成，哈扎拉人就屡屡受到阿富汗最大的民族普什图人的迫害，很多人从各个地方被迫逃到阿富汗中部山区。这个地区被叫做“哈扎拉贾特”。哈扎拉贾特山区以 巴米扬 为中心，横跨阿富汗的多个省份，占阿富汗领土的三成。在普什图人 多斯特·穆罕默德·汗 统治的巴拉克扎伊王朝里，居住在哈扎拉贾特的哈扎拉人被课以重税。但这段时期哈扎拉人还得以部分的 地方自治 。到了他的孙子阿卜杜尔·拉赫曼·汗任埃米尔的时期，由于一些哈扎拉人支持阿卜杜尔·拉赫曼的叔父，被阿卜杜尔·拉赫曼用 军事手段 镇压。

1893年哈扎拉人再次反叛，并出其不意收复了哈扎拉贾特的大部分地方，但因弹尽粮绝最终再次被阿卜杜尔·拉赫曼镇压。这段时期，半数的哈扎拉人被杀死，很多哈扎拉人的财产被普什图人抢走，以至于被迫流落在各个大城市内寻找谋生之路。阿卜杜尔·拉赫曼对哈扎拉人的残暴统治造成了后世哈扎拉人和普什图人之间长期的民族仇恨。

1940年在 穆罕默德·查希尔 ·沙赫的统治下，阿富汗政府对哈扎拉人加税，同时普什图人免税并可以从政府拿到补助，这使得哈扎拉人再次反叛。在政府镇压了这个反叛之后，去掉了这个新税。1979年 苏联 侵占阿富汗之后，哈扎拉人没有像其他民族一样强烈抵抗，而是自己内部各派互相争斗。最终受到 伊朗 支持的宗教武装战胜了世俗武装，取得了哈扎拉贾特的 控制权 。在苏军撤退之后，哈扎拉人分成两派，分别支持和反对拉巴尼政府。在1996年塔利班占领 喀布尔 之后，哈扎拉人团结一致，和 北方联盟 联合。但在1998年哈扎拉贾特被 塔利班 占领，大量哈扎拉人被普什图人为主的塔利班杀害。

哈扎拉人希玛·萨马尔，阿富汗独立 人权委员会 主席。2001年美国遭到9.11 袭击事件 之后，因为认为塔利班庇护 基地组织 ，美国出兵阿富汗，打败了塔利班。哈扎拉人得到前所未有的权利，包括接受 高等教育 、参军等。哈扎拉人哈吉·穆罕默德·马哈吉吉还参加了2004年的阿富汗 总统选举 。

“哈扎拉”是波斯语，意为“一千”。有些学者认为，哈扎拉是成吉思汗及其后人西征后在阿富汗留下的驻屯兵的后裔。早在13世纪上半叶， 蒙古军队 占领波斯和中亚一些地区后，就留归镇守官统辖，并留下少量军队驻屯。后来，成吉思汗之孙蒙哥又以千户为单位派遣驻屯军到这里，这些军人的后代就留了下来，与当地的波斯人、塔吉克人、突厥人通婚，融合、繁衍、发展。于是，“哈扎拉”就成了他们的称呼，意指“千户”的后裔。

据欧洲 旅行家 报道，直到16世纪初，哈扎拉人还在使用蒙古语，后来才淡忘。他们通用 波斯语 。但他们所讲的波斯语里仍夹杂看不少蒙古语和 突厥语 词汇，与纯正波斯语相比存有区别。

从生理特征上看，哈扎拉人属于 欧罗巴人种 和 蒙古人种 的混合类型，具有蒙古人的体质特征：他们长的大脸盘、 高颧骨 、少胡须、斜 眼角 ，并有 内眦褶 相等。虽然他们由于长期以来与当地民族通婚，这些特征已不大典型，若干世纪后经过长期演化甚至还可能完全消失，但不能因此而怀疑他们的蒙古族源。

2003年根据英国 牛津大学 遗传科学家赛克斯通过 人类染色体 和 DNA 样本的调查，其中三分之一的哈扎拉人具有成吉思汗和蒙古人的 遗传基因 ，因此完全体现了他们的蒙古族源。

与此同时，伊斯兰教的毛拉、男性亲属和尊贵客人则聚集在一个大帐篷里，由毛拉诵经析祷，祝贺新人，这一切做完以后，人们把新郎引到唱完离别曲的新娘跟前，新郎将新娘领出帐篷，帮助她骑上早已备好的马或骆驼。新娘家派一位年长女眷与新娘同乘一匹座骑，一直陪送她到新郎家。如果新郎家与新娘同住一村，接亲的队伍则需绕村一周。婚礼期间，一般还要举行赛马、摔跤等娱乐活动，以示庆贺。

哈扎拉人的婚姻多为 一夫一妻制 ，只有少数富有者为一夫多妻。婚姻由父母包办，几乎没有自由恋爱。订婚这天，男女双方的父亲要举行一个 换包 仪式。男方家长事先要在给亲家的包里放入一定数量的钱，换包以后，就按人头分糖，凡参加者都得到一份。

在服装上，哈扎拉的男人上衣穿 无领 肥大衬衫， 下衣 穿灯裤，冬季外罩长袍，腰间束带，有的还要加上一件 坎肩 。在家时头戴绣花小帽，外出时头缠深色或白色缠头。女人服装与男人的大同小异，基本一致，只是妇女不 束腰带 ，只将头巾包在头上，面部裸露，这与教规的要求有所不同。哈扎拉人的穿着打扮已被 中亚 穆斯林 民族同化 ，已没有了蒙古服装的遗风。