|
支持大量的常见化学文件格式。
支持的输入类型有:alc (
Alchemy
文件),prep (
Amber
PREP文件),bs (Ball & Stick文件),caccrt (
Cacao
直角坐标文件),ccc (CCC文件),c3d1 (
Chem3D
直角坐标1文件),c3d2 (
Chem3D
直角坐标2文件),cml (Chemical Markup Language文件),crk2d (CRK2D文件),crk3d (CRK3D文件),box (Dock 3.5 Box文件),dmol (
DMol3
直角坐标文件),feat (Feature文件),gam (
GAMESS
输出文件),gamout (
GAMESS
输出文件),gpr (
Ghemical
工程文件),mm1gp (
Ghemical
MM文件),qm1gp (
Ghemical
QM文件),hin (
HyperChem
HIN文件),jout (
Jaguar
输出文件),mmd (MacroModel文件),mmod (MacroModel文件),out (MacroModel文件),dat (MacroModel文件),car (MSI Biosym/
Insight II
CAR文件),sdf (MDL Isis SDF文件),sd (MDL Isis SDF文件),mdl (MDL Molfile文件),mol (MDL Molfile 文件),mopcrt (
MOPAC
直角坐标文件),mopout (
MOPAC
输出文件),mmads (MMADS文件),mpqc (
MPQC
文件),bgf (MSI BGF文件),nwo (
NWChem
输出文件),pdb (PDB文件),ent (PDB文件),pqs (
PQS
文件),qcout (
Q-Chem
输出文件),res (ShelX文件),ins (ShelX文件),smi (SMILES文件),mol2 (Sybyl Mol2文件),unixyz (UniChem XYZ文件),vmol (ViewMol文件),xyz (XYZ文件)。
支持的输出类型有:alc (
Alchemy
文件),bs (Ball & Stick文件),caccrt (
Cacao直角坐标文件),cacint (Cacao
内坐标文件),cache (
CAChe
MolStruct文件),c3d1 (
Chem3D
直角坐标1文件),c3d2 (
Chem3D
直角坐标2文件),ct (
ChemDraw
连接关系表文件),cht (Chemtool文件),cml (Chemical Markup Language文件),crk2d (CRK2D文件),crk3d (CRK3D文件),cssr (CSD CSSR文件),box (Dock 3.5 Box文件),dmol (
DMol3
文件),feat (Feature文件),fh (Fenske-Hall Z-Matrix文件),gamin (
GAMESS
输入文件),inp (
GAMESS
输入文件),gcart (
Gaussian
直角坐标文件),gau (
Gaussian
输入文件),gpr (
Ghemical
工程文件),gr96a (
GROMOS
96 (A)文件),gr96n (
GROMOS
96 (nm)文件),hin (
HyperChem
HIN文件),jin (
Jaguar
输入文件),bin (OpenEye二进制文件),mmd (MacroModel文件),mmod (MacroModel文件),out (MacroModel文件),dat (MacroModel文件),sdf (MDL Isis SDF文件),sd (MDL Isis SDF文件),mdl (MDL Molfile文件),mol (MDL Molfile文件),mopcrt (
MOPAC
直角坐标文件),mmads (MMADS文件),bgf (MSI BGF文件),csr (MSI Quanta CSR文件),nw (
NWChem
输入文件),pdb (PDB文件),ent (PDB文件),pov (POV-Ray输出文件),pqs (
PQS
文件),report (Report文件),qcin (
Q-Chem
输入文件),smi (SMILES文件),fix (SMILES Fix文件),mol2 (Sybyl Mol2文件),txyz (
Tinker
XYZ文件),txt (Titles文件),unixyz (UniChem XYZ文件),vmol (ViewMol文件),xed (XED文件),xyz (XYZ文件),zin (
ZINDO
输入文件)。文件类型基于扩展名。
支持化学MIME。
SMARTS匹配器。
柔性原子打印。
柔性键打印。
部分电荷计算。
添加或删除氢。
支持同位素,进行平均计算。
自动猜测环,键,杂化,芳香性。
多构象分子存储。
命令行转换一个文件中的多个分子。
命令行界面。
二进制矢量类。
矢量与矩阵的转换。
分子测试组。
|