2024
年
5
月
8
日,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所、深圳合成生物学创新研究院
的
甘海云
研究员课题组
,美国明尼苏达大学
Hormel
研究所的
于传贺
教授和四川大学华西医院
生物治疗全国重点实验室
、
疾病分子网络前沿科学中心
的
韩俊宏
教授课题组在
PNAS
(
Proceedings of the National Academy of Sciences
)
发表了题为
“DNA
聚合酶
δ
调控亲代组蛋白传递到
DNA
复制的滞后链上(
DNA polymerase delta governs parental histone transfer to DNA replication lagging strand
)
”
的文章,该研究发现聚合酶
δ
(
Pol δ
)在
DNA
复制期间作为关键伴侣蛋白,将亲代组蛋白传递到滞后链上,确保携带亲代组蛋白翻译后修饰的表观遗传信息能够忠实地传递给子代细胞。这一发现揭示了
Pol δ
在复制
DNA
滞后链时促进亲代组蛋白遗传的精细过程。
Pol δ
被认为参与
D
NA
损伤修复过程,但其功能未知,这提示组蛋白回收可能参与
D
NA
损伤修复过程。
在前不久的
3
月
8
日,同样由
甘海云
研究员课题组
及美国明尼苏达大学
Hormel
研究所的
于传贺
教授在
NAR
(
Nucleic
Acids
Research
)
发表题为
“
亲代组蛋白
传递
缺陷通过增加游离组蛋白的浓度来降低同源重组的频率(
Defective transfer of parental histone decreases frequency of homologous recombination by increasing free histone pools in budding yeast
)
”
的文章,该研究明确了亲代组蛋白
H3-H4
四聚体传递
遭到破坏时产生
的遗传和表观遗传结果。这一发现揭示了
DNA
复制过程中亲代组蛋白正确传递不仅对维持染色质结构的稳定性至关重要,而且任何由于亲代组蛋白传递缺陷导致的同源重组活性降低都可能对细胞健康产生不利影响。
DNA
复制和组蛋白
传递
是生物体内两个紧密相连的过程,它们共同确保了遗传信息的准确传递和生物体的正常运作。在
DNA
复制过程中,复制叉前的亲代核小体结构需要被解组装,同时,亲代核小体上的组蛋白会被
传递
到复制叉后面新生成的子链
DNA
,包括前导链(
leading strand
)和滞后链(
lagging strand
)
上重新组装形成核小体,实现表观遗传信息的传递和继承。近年来,甘海云研究员与合作者通过开发能特异性检测
DNA
复制过程中前导链和滞后链结合蛋白的技术
(enrichment and sequencing of protein-associated nascent DNA
,
eSPAN
),发现
DNA
聚合酶
Pol ε
在合成
D
NA
的同时,其亚基
Pole3
和
Pole4
还负责将亲组蛋白传递到前导链(
Science, 2018
)。
Mcm2
(
Mcm2-7
解旋酶的一个亚基)通过
Pola
将亲组蛋白传递到复制
DNA
的滞后链(
Molecular Cell, 2018
)。
但MCM2
本身位于
Leading
链上,
Polα
只能合成
RNA
引物和大约
30nt
的
DNA
序列,表明仅凭目前已知的通路无法完成
Lagging
上的组蛋白回收,这一直成为科研工作者们探索的谜题。
甘海云
研究员
课题组
及其合作者
经过大量的筛选和实验验证,最后发现滞后链
DNA
聚合酶
δ
的非必需亚基
Pol32
的缺失,会导致复制过程中亲代组蛋白
H3-H4
主要传递到前导链。进一步的生化分析表明,
Pol32
在体内和体外都能与组蛋白
H3-H4
结合(图
2
)。
近年来研究发现亲代组蛋白的遗传对子细胞的表观重建、分化特征维持、乃至个体发育都至关重要。
DNA复制
偶联的亲代组蛋白传递保证了表观基因组的稳定遗传,甘海云和合作者此前发现解旋酶亚基MCM2
和
D
NA
聚合酶
polα负责亲代组蛋白向滞后链的传递。然而,M
CM2本身
位于前导链上,
polα作为引物酶只能合成滞后链复制所需的R
NA
引物和大约
3
0nt的DNA
序列,很显然无法完成整个滞后链的亲代组蛋白回收。这个问题也一直成为谜题。这项研究甘海云领衔的团队发现在酵母细胞中
D
NA
聚合酶
polδ的非必需亚基pol
32
可以作为组蛋白伴侣将亲代组蛋白至滞后链,该研究完成了
D
NA
复制偶联的组蛋白回收通路的最后一块拼图,完善了
D
NA复制偶
联组蛋白回收的理论,把
DNA复制和染色质复制终于统一到了一起
。另外,有证据表明
polδ可能参与D
NA损伤修复过程,甘海云和合作者最近的NAR文章也发现亲代组蛋白传递缺陷会影响同源重组频率。这些研究不仅填补了先前对组蛋白回收机制的认识空白,还为研究DNA损伤修复过程中的染色质修复提供了新的视角。
甘海云博士,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所研究员,博士生导师。近五年来研究成果发表在
Science、Nature Medicine、Nature Genetics、Molecular Cell、Nature Communications、Genes & Development、PNAS、eLife、The EMBO Journal、Nucleic Acids Research
等知名期刊,累计引用超过
3400次。
课题组主要研究方向为利用系统生物学、合成生物学以
“干湿”实验结合的模式研究表观基因组信息的传递机制以及其在肿瘤发生和耐药性产生、全能性细胞(
2C)、细胞衰老、染色体外DNA(ecDNA)、合成表观重构、DNA复制起始分子复合物、人工细胞等的表观遗传调控机制。
课题组现招聘有表观基因组学、合成生物学、生物信息学、肿瘤生物学、细胞生物学等任一相关研究背景博士后1-2名,研究助理2-3名,欢迎志同道合的朋友投送简历至[email protected],简历及邮件标题注明“应聘岗位-学校名称-专业-姓名”。