该博客介绍了如何使用SPSS进行生存分析,特别是计算乳腺癌患者3年或5年的生存率。通过KM方法(Kaplan-Meier)展示了比较淋巴结肿大和未肿大患者生存率的步骤,包括设置分析选项、选择统计检验、生成生存函数图,并提供了事件分析表和生存率计算。最终,结果显示两者生存率存在显著差异。
摘要由CSDN通过智能技术生成
生存率是我们生存分析的重要结果。后台有粉丝问我如何使用SPSS计算患者3年或5年的生存率,SPSS计算患者生存率还是比较简单的,有两种方法可以计算,我们一一来演示。继续使用我们的乳腺癌数据(公众号回复:乳腺癌可以获得数据),首先把数据导入
我们来看一下数据
age表示年龄,pathsize表示病理肿瘤大小(厘米),lnpos表示腋窝淋巴结阳性,histgrad表示病理组织学等级,er表示雌激素受体状态,pr表示孕激素受体状态,status结局事件是否死亡,pathscat表示病理肿瘤大小类别(分组变量),ln_yesno表示是否有淋巴结肿大,time是生存时间,后面的agec是我们自己设定的,不用管它。
导入数据后,
假设我们想比较淋巴结肿大和没有淋巴结肿大患者5年的生存率有无区别?
我们依次点击
分析----生存分析—KM方法
在对话框中依次填入各选项
比较因子中选择轶检验
保存这里都选上
选项这里勾选生存分析函数图
最后点击确定就可以了,我们来看看结果,先看事件分析表
注意上面是没有淋巴结肿大的表,还有淋巴结肿大的表
根据上表我们可以轻易得出生存率各种数据,也可以得出生存函数图
通过轶检验得出有无淋巴结肿大生存率存在差异
另一种方法:
我们重新回到界面
我们只要算出60个月内的死亡人数,然后除以总人数就可以得出死亡率和生存率
点击
分析—对个案计数
然后填好你需要的时间截点
生成S1变量后对它进行统计就可以了
由此可以知道,60个月内死亡59例,除以1207,死亡率为4.89%,生存率为95.11%,这里要注意一下,我这里算的是总死亡率,如果是单项的话要分开来计算。
生存率是我们生存分析的重要结果。后台有粉丝问我如何使用SPSS计算患者3年或5年的生存率,SPSS计算患者生存率还是比较简单的,有两种方法可以计算,我们一一来演示。继续使用我们的乳腺癌数据(公众号回复:乳腺癌可以获得数据),首先把数据导入我们来看一下数据age表示年龄,pathsize表示病理肿瘤大小(厘米),lnpos表示腋窝淋巴结阳性,histgrad表示病理组织学等级,er表示雌激素受体状态,pr表示孕激素受体状态,status结局事件是否死亡,pathscat表示病理肿瘤大小类别(分组变量),
具体的方法和术语我们先不讲,首先来看例子。
案例:为了解肺癌
患者
接受某种治疗后的生存状况,研究者收集了12名肺癌
患者
手术加化疗的住院资料。他们的生存时间(月)分别为:2, 5, 8, 9, 9+, 10, 13, 13, 15+, 18, 20, 23+。
试问,采用该治疗方案的12名
患者
的术后
生存率
如何?(案例来自相关教科书,有删改)
如何来评判这种治疗方法的生存..
4)nomogram
( 根据cox回归结果,建立了中位生存时间,1
年
5
年
生存率
的概率
计算
)
-------------------????????♀️本文只有干货,非常干!????-----------------------------
一、数据加载
#生存分析
library("survival")
library("survminer")
data("
为什么要使用生存分析而不是使用传统方法,大家可参考(理论介绍的非常详细)
https://wenku.baidu.com/view/453b1a0c26284b73f242336c1eb91a37f11132d2.html
传统方法在分析随访资料时的困难
(随访是指医院对曾在医院就诊的病人以通讯或其他的方式,进行定期了解患...
spss
分析方法-生存分析(转载)生存分析,是一种将生存时间和生存结果综合起来对数据进行分析的一种统计分析方法。主要用于对涉及一定时间发生和持续长度的时间数据的分析。
下面我们主要从下面四个方面来解说:
一、实际应用
生存分析最早可追溯至19世纪的死亡寿命表,但现代的生存分析则开始于20世纪30
年
代工业科学中的相关应用。第二次世界大战极大地提高了人们对武器装备可靠性的研究兴趣,这一研究兴趣延续到战后对武器装备及商品的可靠性研究。此时生存分析的大多数研究工作都集中在参数模型,直至20世纪60~70
年
代,
生存描述-描述不同时间的总体
生存率
,
计算
中位生存时间,绘制生存函数曲线,一般用Kaplan-Meier方法和寿命表法;
生存曲线比较-比较不同处理组的
生存率
,一般用logrank检验;
生存相关因素的分析:回归模型;由于logrank检验仅能分析一个因素,因此两个或者两个以上因素的分析需要使用Cox比例风险模型;
2、生存分析使用的方法:
Kaplan-Meier plots
相对危险度,又称为危险度比,是暴露组的危险度与对照组的危险度之比,相对危险度表明暴露组发病率或死亡率是对照组发病率或死亡率的多少倍,通过相对危险度,我们可以得知暴露指标与疾病的关联程度是弱还是强。
在IBM
SPSS
Statistics 专业统计软件中就集成了相对危险度的
计算
分析功能,让我们来学习一下吧!
一、交叉表统计设置
要
计算
相对危险度,首先数据需要满足2个条件,第一:因变量和自变量都是二分类变量;第二:各观测数据之间相互独立。因此,我们采用下图1的数据进行相对危险度
计算
,它们都是二分类变量.
好比身高的样本均数,抽取的第一拨人
计算
的平均身高和第二拨人的平均身高是有差异的。
因为它们都是样本统计量,所以会随着样本的变化而变化。同样地,如果我们想象一下,把这些样本统计量放在一起再求平均数和标准差,那这次得到的这个标准差叫做什么呢?
还记得吗?叫标准误。..
ROC曲线也叫受试者工作曲线,原来用在军事雷达中,后面广泛应用于医学统计中。ROC曲线是根据一系列不同的二分类方式(分界值或决定阈),以真阳性率(灵敏度)为纵坐标,假阳性率(1-特异度)为横坐标绘制的曲线。
ROC曲线主要应用于二分类结局,比如是否死亡,疾病诊断,肿瘤复发等等,可以用于自变量为连续变量的截点判定。
可以做ROC曲线的软件很多,如
SPSS
,R语言,Stata, SAS等等,其中
SPSS
非常简单,适合完全没有基础的初学者,今天我们就来使用
SPSS
作出一个符合论文发表的ROC曲线。
首先打开SP
在
SPSS
中
计算
RMSE,可以通过先
计算
预测值与真实值之间的平方差,然后求平均值并开平方根得到结果。具体步骤如下:
1. 首先,将预测值和真实值导入
SPSS
数据集,并确保它们在同一列或变量中。
2. 在
SPSS
中,选择“数据”选项卡,然后选择“
计算
变量”。
3. 在弹出的窗口中,为新变量命名,例如“RMSE”。
4. 在“
计算
表达式”框中,输入公式:SQRT(MEAN((预测值-真实值)^2))。
5. 点击“确定”按钮以执行
计算
。
通过上述步骤,你就可以在
SPSS
中
计算
出RMSE的值。请注意,这个
计算
过程是基于RMSE的定义,即均方根误差是观测值与真值偏差的平方和与观测次数的比值的平方根。<span class="em">1</span><span class="em">2</span><span class="em">3</span>
#### 引用[.reference_title]
- *1* *2* *3* [均方根误差(RMSE),平均绝对误差(MAE),标准差(Standard Deviation)的对比](https://blog.csdn.net/capecape/article/details/78623897)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v93^chatsearchT3_2"}}] [.reference_item style="max-width: 100%"]
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